As Águas Ruças (AR), também designadas como Alpechin, Margine ou Jamila, são uma mistura de águas de vegetação, directamente extraídas das azeitonas, e águas resultantes do processo produtivo do azeite, provenientes de lavagens e do processamento. O conjunto destas águas formam as AR. Sendo biologicamente caracterizadas pela presença de uma grande variedade de microrganismos, incluindo bactérias, fungos e leveduras, as AR apresentam, normalmente, pH ácido e elevadas quantidades de azoto orgânico, potássio e polifenóis. É possível reutilizar as AR para diversos fins, tais como irrigação, compostagem, etc, mas só depois de tratamentos adequados para reduzir a salinidade, a carga orgânica e a acidez.

Os Bagaços Húmidos , (em inglês Olive Cake, Husks ou Crude Olive) são sub-produtos constituidos por cascas, caroços, polpa e uma percentagem variável de águas residuais, dependendo do tipo de extracção (2 ou 3 fases). Os bagaços de azeitona, apresentam tipicamente pH ácido e contêm elevadas concentrações de polifenóis e de ácidos gordos . Se forem correctamente tratados, os bagaços de azeitona são materiais aptos para a produção de fertilizantes,  compostados e combustíveis.

Resíduos resultantes da extracção centrífuga  do azeite, processo de 2 fases,  maioritariamente utilizado em Espanha. Os bagaços húmidos de 2 fases são constituidos pela manutenção da AR e dos resíduos sólidos num só material.

Pasta residual, que é produzida se existe um processo de descaroçamento prévio ao processamento da azeitona. Esta pasta residual tem elevado teor em água, o que torna o processo do seu armazenamento extremamente difícil.

Devido ao elevado teor energético e ao baixo custo, os caroços são habitualmente utilizados, em cru, substituindo a utilização de pellets na produção de combustivel.

Ramos, folhas e madeira provenientes das podas dos olivais são os únicos sub-produtos que se podem classificar directamente como biomassa (primária).